Ay çöreği dolgularında genellikle ceviz, badem, susam, kavun çekirdeği, alıç, lotus tohumu ezmesi, kırmızı fasulye ezmesi ve hünnap ezmesi gibi sağlık açısından belirli faydalar sunan bitki bazlı tohumlar-kullanılır.
Bitki- bazlı tohumlar, başta oleik ve linoleik asitler olmak üzere, doymamış yağ asitleri bakımından yüksektir; bunlar, kan damarlarını yumuşatmak ve damar sertliğini önlemek için faydalıdır. Ayrıca bağışıklığı güçlendirmeye ve çocuklarda çinko eksikliğini ve demir{2}}demir eksikliği anemisini önlemeye yardımcı olan mineraller de içerirler. Lotus tohumları, kırmızı fasulye ve susam tohumları, hücrelerdeki sodyumun değiştirilmesine yardımcı olan, kalp kasını besleyen ve kan basıncını düzenleyen potasyum açısından zengindir. Geleneksel Çin tıbbı perspektifinden bakıldığında, bu bileşenlerin çoğu hafif nitelikte olup kalbi güçlendirir, sinirleri yatıştırır ve rahatlamayı destekler. Bazı tohumlar, yaşlanma karşıtı özelliklere sahip olan ve cildi ve saçları besleyen E vitamini açısından zengindir.
Ay kekleri kan damarlarını yumuşatabilir, damar sertliğini önleyebilir ve bağışıklığı güçlendirebilir.